[后台点播·变异毒株] 近期Omicron家族动态小结
前言
那么今天就简单八卦一嘴得了。没提前做功课,纯印象流,想到哪儿说到哪儿~另外部分图片搬运自推友Raj Rajnarayanan老师,照惯例鸣谢一发。
在正式开始今天的扯淡之前,
咱不得不提一嘴,之前北大谢老师那篇大作里面的一点发现~
详见:《原罪(第四集)》
具体来说,由于既往感染的免疫印记,
再次感染BA.1(以及BA.2)后产生的中和抗体,
有可能被限制在较少的,对原始株和Omicron有交叉免疫的表位上,
——请品鉴:
于是根据谢老师他们这个假说,
后续的新发变异株,只需要针对上述较少的表位演化出适应性突变,
就能有效实现免疫逃逸~
而这,正是近期咱们观测到的现状。
首先,之前咱们已经提到过了,
Omicron家族正在发生前所未有的轰轰烈烈的趋同演化~
全球多地不约而同地冒出来带有刺突蛋白L452突变的新发子毒株,
——请品鉴:
一个多月之后回头来看,
当时咱们可能还低估了这一波趋同演化大潮……
比如说,现如今已称霸纽约(或者说整个美东)的BA.2.12.1,其实并不是偶然,
它的上一辈(BA.2.12),至少两次独立获得过刺突蛋白L452Q突变。
然后带有其他L452突变的Omicron徒子徒孙们也在努力抢占市场~
可能最典型的例子,要属下面这张图……
——请品鉴:
以上是密苏里大学废水监测界大佬Marc Johnson老师的抱怨,
最近密苏里州的废水监测发现,
有足足5种带有刺突蛋白452位点不同突变的变异株在神仙打架……
分别是:
BA.4/BA.5:刺突蛋白452R;
BA.2.12.1:刺突蛋白452Q;
BA.2.13:刺突蛋白452M;
BA.2:刺突蛋白452L;
以及,某款还没命名的Omicron子毒株:刺突蛋白452P
……
……
各位以为这就完了吗?
难道Omicron真的像NIH御用专家王博士说的那样,从此在刺突蛋白452位点一棵树上吊死了吗?
naive……
在刺突蛋白452位点趋同演化进入白热化阶段之后,
Omicron又开始转头搞刺突蛋白K417T的趋同演化了
是的各位你们没看错,
就是当初Gamma同款的刺突蛋白K417T。
截止这周咱们已经提交了至少5个特征定义突变=S:K417T的新变异株申请,
Pango的老师们估计头都大了……
至于这股趋同演化的妖风有多猛呢?
——请品鉴:
也就是相对增长优势每周50%左右,
一举拿下印度和大马三成市占率的程度而已啦
还有呢~
除了452和417之外,
趋同演化还出现在68、346和356等多个位点~
并且毫不意外,以上全部是可以有效针对既往感染实现免疫逃逸的位点。
——比如说,相对增长优势每周30%左右的S:R346T,请品鉴:
(为啥又是印度……)
更想不通的是,
趋同演化的风潮,还涉及到非常少见的插入突变
各位想必记得,当初BA.1有一段招牌式的刺突蛋白213位点EPE插入突变,
最近两个月,BA.2也开始频繁冒出来类似的玩意儿了……
——比如,请看:
丹麦那边至少两次独立出现的BA.2+刺突蛋白213GRG插入突变,
英国和德国也分别有213位点插入突变的奇葩出现……
——相对增长优势每周45%,请品鉴:
最后,重组狂潮仍然在继续~
Pango那边还有5-6组重组株正在等着命名呢,
不过那些都是BA.1和BA.2互相乱搞的产物罢了,没啥新意……
有新意的,可能还属下面这玩意儿~
(以下是全网独家剧透哦)
——请品鉴:
三天前秘鲁那边刚刚上传的Gamma+Omicron重组株可还行?
(严格来说是P.1.7.1+BA.1.1)